Добрый день.Столкнулся с аналогичной проблемой: Jenkins в логах вместо кириллицы писал знаки вопроса,и параметры на кириллице (которые посылал в автотест через дженкинс) тоже приходили в виде знаков вопросов.
Помогло следующее решение:
1) На удаленной машине,которая в роли Slave, стал запускать slave.jar c кодировкой UTF-8 (java -Dfile.encoding=UTF8 -jar C:\slave.jar -jnlpUrl ....)
2) В проекте jenkins, в разделе «Выполнить команду Windows» запускать команду со сменой кодировки : chcp 65001